Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chrac1Q9JKP8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrac1Q9JKP8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms