Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pole3Q9JKP7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms