Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scamp5Q9JKD3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scamp5Q9JKD3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms