Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Uchl3Q9JKB1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Uchl3Q9JKB1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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