Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cngb3Q9JJZ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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