Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cnga3Q9JJZ8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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