Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tuba8Q9JJZ2 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tuba8Q9JJZ2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms