Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJA2

Cog8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog8Q9JJA2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cog8Q9JJA2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms