Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc86Q9JJ89 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Ccdc86Q9JJ89 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ccdc86Q9JJ89 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Ccdc86Q9JJ89 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc86Q9JJ89 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Ccdc86Q9JJ89 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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