Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gtf2ird1Q9JI57 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms