Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trim39Q9ESN2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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