Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Rb1cc1Q9ESK9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rb1cc1Q9ESK9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms