Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lima1Q9ERG0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms