Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Slco1c1Q9ERB5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms