Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snap29Q9ERB0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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