Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SgshQ9EQ08 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms