Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sil1Q9EPK6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sil1Q9EPK6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sil1Q9EPK6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sil1Q9EPK6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sil1Q9EPK6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sil1Q9EPK6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms