Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsc1Q9EP53 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms