Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tspan4Q9DCK3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tspan4Q9DCK3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tspan4Q9DCK3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Tspan4Q9DCK3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tspan4Q9DCK3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tspan4Q9DCK3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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