Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCE5

Pak1ip1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1ip1Q9DCE5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pak1ip1Q9DCE5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pak1ip1Q9DCE5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms