Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csnk1dQ9DC28 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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