Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syvn1Q9DBY1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms