Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg9Q9DB90 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smg9Q9DB90 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smg9Q9DB90 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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