Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fundc1Q9DB70 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fundc1Q9DB70 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms