Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cnn3Q9DAW9 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms