Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TrmuQ9DAT5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms