Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Smim23Q9DAL0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms