Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmbim4Q9DA39 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmbim4Q9DA39 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms