Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Actrt2Q9D9L5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Actrt2Q9D9L5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms