Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cnot8Q9D8X5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cnot8Q9D8X5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms