Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rpl4Q9D8E6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 282.5 ms