Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vstm5Q9D806 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vstm5Q9D806 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms