Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn9Q9D805 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn9Q9D805 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms