Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sh2d4aQ9D7V1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sh2d4aQ9D7V1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms