Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Clic3Q9D7P7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Clic3Q9D7P7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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