Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn23Q9D7D7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn23Q9D7D7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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