Protein–RNA interactions for Protein: Q9D720

Nsmce1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce1Q9D720 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nsmce1Q9D720 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nsmce1Q9D720 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms