Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gbe1Q9D6Y9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms