Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Borcs6Q9D6W8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Borcs6Q9D6W8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms