Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rtl8cQ9D6I0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rtl8cQ9D6I0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms