Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rab11fip1Q9D620 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms