Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PudpQ9D5U5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PudpQ9D5U5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms