Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D5Q8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms