Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms