Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sf3a3Q9D554 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms