Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc7Q9D541 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms