Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pus10Q9D3U0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms