Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stag1Q9D3E6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Stag1Q9D3E6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 560.3 ms