Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rufy3Q9D394 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rufy3Q9D394 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms