Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt20Q9D312 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms